拍擊式均質器使用無菌均質袋，拍擊的機械裝置作用在均質袋上，不和樣品直接接觸，因此不會受污染。拍擊式均質器由于使用方便，不易受污染，使用越來越廣泛。但其缺點是均質的力量不足，對于堅硬的樣品不但無法均質均勻，還會引起均質袋的破損。

注意事項：

1.電源插頭必須插緊到位，出現松動可能影響電腦控制器造成死機，如出現死機現象，請關閉后側電源開關，關機3分鐘后重新啟動。

2.儀器和均質袋的存放都應避免陽光的直接照射，特別是均質袋應存放在無陽光或避免紫外線照射的地方，以免老化。

3.均質器門底部為防止均質袋意外破裂，便于清洗溢出物，底部設計為空的，可放置接水盤，所以儀器運轉時請勿用手從底部伸入，以免紋傷手指。均質器工作時最好不要打開均質器門，造成不必要的損失。

4.儀器長期不使用應切斷電源，撥去插頭。防止無菌均質器內部電子元器件老化。

5.硬塊，骨狀，冰狀物等堅硬銳利的物質不宜使用，以免破壞均質袋。